A Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós-Graduação (PRPPG) possui nova estrutura organizacional contando com duas coordenações, a de Pesquisa (CP) e a de Pós-graduação (COPG). O Pró-reitor Antônio Carlos Doriguetto é assessorado pelo Prof. Cláudio Viegas Junior, Pró-reitor adjunto e Coordenador de Pesquisa e pela Prof Marília Caixeta Franco Ariosa, coordenadora de Pós-graduação. Com a nova estrutura, espera-se melhor atender a crescente demanda da pós-graduação Latu e Strictu sensu apoiando os cursos recomendados e as comissões que estudam novas propostas a serem submetidas à Capes. Este setor está funcionando, provisoriamente, no prédio K sala 107, sendo secretariado pelo servidor Thiago Bueno Pereira.